Народився Сергій у Харкові. Після закінчення загальноосвітньої школи №42 вступив до Харківського автотранспортного фахового коледжу, де навчався за спеціальністю «Обслуговування та ремонт автомобілів та двигунів». Згодом отримав кваліфікацію техніка-механіка. Працював автомеханіком. Захоплювався мотокросом.
У повномасштабній війні боронив країну в лавах 53-ої окремої механізованої бригади імені князя Володимира Мономаха. Обіймав посаду гранатометника 2-го механізованого батальйону
«Найвищою нагородою тих, хто вцілів, – є життя, а для загиблих – пам’ять… Ми пам’ятаємо Сергія, який був спокійним, скромним, тихим, вихованим, був патріотом своєї школи, свого рідного Харкова, завжди приходив на допомогу однокласникам, був гарним спортсменом, захоплювався мотокросом. Мав гарні оцінки з усіх предметів, перевагу надавав фізичній культурі, трудовому навчанню, природничим предметам. Його побратими зазначили, що Сергій – справжній воїн, вірний товариш, людина слова та мужності. Для нього справедливість і честь були завжди на першому місці. Він любив свою країну, своє рідне місто Харків, хотів помститися окупантам за все те зло, яке вони принесли на нашу землю, і захистити тих, хто не може захиститися сам. Сергій мріяв про перемогу і робив усе для того, щоб гідно протистояти ворогу. Таким він був, таким він є, таким він залишиться навіки…», – розповіли в Харківській гімназії № 42.
Поховали захисника у Харківському міському кладовищі №18.
У Сергія залишилися мама Катерина Миколаївна та батько Олег Володимирович.
Рішенням виконавчого комітету Харківської міської ради пам’ять про Кротченка Сергія вшановано відкриттям меморіальної дошки на будівлі Харківської гімназії № 42.
